Mi sa che ripeto solo i consigli di chi ha già risposto, comunque:
Io quando proprio devo contare conto le battute con le dita della mano, e nel frattempo mi dico anche il numero.
Ma tengo anche sempre le orecchie ben aperte, perché conunque durante le mie battute di pausa la musica va avanti con una struttura sempre riconoscibile. Per esempio, restando ai casi che hai citato tu, con dei cambi di ritmo...
Se non trovo riferimenti sulla mia partitura, di solito me li scrivo io: qui attaccano gli archi, lì c'è il tema ai clarini, quello sforzato è alla battuta 51 e così via...
Tutto questo potrebbe aiutare a dare un senso ai numeri.
E ad ogni modo, anche le indicazioni di chi dirige dovrebbero servire a far entrare chi suona al momento giusto...
Ciao!